渗透力对热熔胶棒的粘接效果起着非常重要的作用，适当的渗透可以使热熔胶棒更加粘稠，即使胶水层老化，也能在基板上保持一定的粘合度。

粘合剂和材料表面融合得越好，粘合效果越好，这与粘合材料的分子间间距和粘合剂的分子大小有关。热熔胶棒溶解成液体后，其分子在高温下相当活跃。这时，热熔胶棒正处于等待渗透，与器材融合的阶段。当胶水接触到粘性物质的表面时，胶水内不断跳动的分子会不断地寻找缝隙钻进去。如果缝隙足够大，粘合剂分子就会与基材材料融合，用物理现象解释，就会渗透。经过一定渗透的粘合剂，粘合剂层不容易从材料表面分离出来。我们尝试用手去掉粘合层，发现胶水和基材接触的每一处都能看到拉扯，胶体柔软，甚至可以拔出胶水，这说明现在已经干燥的粘合层确实混合了基材表面和分子之间的误差，这是渗透的最终结果。

若是胶水很容易取出，脱离的瞬间也不会出现拉出现象，这并不意味着热熔胶在刚接触基板表面的初期没有渗透。